第一，确认是哪两列数据有差异，期初、期末、本期收入还是本期发出；

第二，是否存在仓存单据没有生成凭证；

第三，总账中手工录入了涉及存货科目的凭证；

第四，凭证模版设置不正确，存货收发与科目不相对；

第五，库存单据金额不等于生成的凭证金额；

第六，查询单据得出有启用之前的暂估外购入库单生成冲回凭证或是有暂估冲回没有继续暂估；

第七，有成本调整单没有生成凭证。

如果想正确的排查差异产生的原因，首先必须清楚各字段的取数来源，先将期末对账界面的各字段的取数分析如下：

（1）期初存在差异：仓存期初余额是取上一期的期初，如仓存是初始化的，则取初始化的数据；总账取上期期末，如总账为初始化的则取总账初始化数据。

（2）本期收入差异：供应链中本期收入是指本期入库类单据（包括调拨单，具体由核算参数“调拨单生成凭证”决定，钩选则包括，反之，不包括）的收入金额；总账取对应科目的借方发生额。

（3）本期发出差异：供应链中是指出库核算后出库类单据上的成本（包括调拨单，同上）；总账是取对应科目的贷方发生额。

（4）期末差异：供应链中期末余额=仓存期初余额仓存本期收入-仓存本期发出；总账中的期末余额=总账期初余额总账借方发生额-总账贷方发生额。